Marina Lazareva, en elev i 10. klasse på det specialiserede uddannelsesvidenskabelige center ved Novosibirsk State University (SESC NSU), har sammen med sine videnskabelige vejledere udviklet et testsystem, der muliggør hurtig detektion af svampe fra slægten. Verticillium uden behov for dyrt udstyr. Disse patogener påvirker over 200 plantearter, herunder kartofler, og forårsager betydelig årlig skade på landbruget. Traditionelle diagnostiske metoder tager 7 til 14 dage, hvilket gør screening i stor skala vanskelig. Selvom PCR-analyse er hurtigere, kræver den kompleks og dyr maskine. Den unge forsker fra Novosibirsk foreslog et alternativ - LAMP-teknologi (loop-medieret isotermisk amplifikation), en meget følsom DNA-kopieringsmetode, der fungerer ved en konstant temperatur. Den kræver ikke en termisk cykler og kan detektere patogenet inden for 30-60 minutter i et standardlaboratorium eller endda under feltforhold.
Først udførte den studerende en bioinformatisk analyse af DNA-sekvenser fra ti forskellige Verticillium art og identificerede et fælles segment. Hun brugte derefter specialiseret software til at designe primere – korte molekyler, der kun genkender og binder til målpatogenets DNA. Den største udfordring var uspecifikke reaktioner, hvor testen udløste selv i rene prøver uden svampen. Ved at optimere forholdene – justering af temperaturen, øgning af primer- og magnesiumionkoncentrationer og brug af en "hot start"-teknik – blev der opnået høj specificitet. Testsystemet reagerer nu kun på målsvampens DNA og har bestået eksperimentel validering.




